Une mise à jour des données est maintenant disponible sur le portail du CQDG !

Dictionnaire v5.5

Chaque étude a été mise à jour vers la dernière version du dictionnaire (BACQ, CARTaGENE, DEE, NeuroDev, PRAGMatIQ)

Une mise à jour du portail du CQDG est maintenant disponible !

Nouveautés

• Le modèle de données et le processus de soumission supportent désormais les métadonnées de fichiers soumises par les utilisateurs (p. ex. expériences, analyses de séquençage et fichiers pour les expériences de séquençage)

Modifications

• Mise à jour du dictionnaire de données vers la version 5.5 avec les métadonnées de fichiers et une documentation améliorée
• Ajout de nouveaux filtres dans l'explorateur de données (p. ex. type d'analyse, programmes)
• Le champ de plateforme de séquençage accepte maintenant plus d'options
• Le champ capture kit de la page de fichiers de données contient maintenant les métadonnées du champ target_capture_kit fourni par le soumissionnaire

Corrections

• Les définitions de pipeline acceptent et affichent maintenant des listes
• Correction des valeurs supportées dans le champ de version du génome de référence
• Correction des liens dans l'explorateur de variants qui changeaient de couleur au survol de la souris
• Correction du traitement des études restreintes

Une mise à jour des données est maintenant disponible sur le portail du CQDG!

Études BACQ et NeuroDev

• Nouveau contrôle de quality sur les fichiers d'alignement
• Nouvelle analyse avec les pipelines nf-core/sarek v3.4.4 et Ferlab post-processing
• Les fichiers de variants annotés (Ensembl VEP) sont maintenant disponibles
• Nouvelles séquences:
  • BACQ: 80 nouveaux exomes
  • NeuroDev: 297 nouveaux génomes
• Nouvelles métadonnées disponibles pour les fichiers -omiques dans l'explorateur de données

Le portail du CQDG est maintenant en ligne ! Accédez-y à portail.cqdg.ca.

Avec le lancement du portail, le CQDG est fier de mettre à la disposition des chercheurs un premier ensemble de données représentant plus de 3 300 participants provenant de cinq études : CARTaGENE, DEE, BACQ, NeuroDev et PRAGMatIQ.

Ceci inclut plus de 84TO de données génomiques issues de 2 944 séquençages du génome entier (WGS) et 386 séquençages de l'exome entier (WXS).

Le portail vous propose également une banque de plus de 90M variants germinaux annotés.

Explorez le tout à https://portail.cqdg.ca