Explorateur de données

Les fichiers dans l'explorateur de données

L'onglet "Fichiers" présente des informations détaillées sur les fichiers sélectionnés à l'aide des filtres appliqués dans l'explorateur de données.

L'onglet "Fichiers de données" se trouve à la droite de l'onglet "Biospécimens" en dessous de la section des requêtes et des filtres.

Afficher plus ou moins de colonnes

Les colonnes présentent des informations supplémentaires sur les fichiers issues de la requête de l'utilisateur. Certaines colonnes sont affichées par défaut. Plus ou moins de colonnes peuvent être affichées à l'aide de l'icône d'engrenage en haut à droite de l'onglet.

Le contenu des colonnes est décrit dans la table ci-dessous.

Titre de la colonne	Description de la colonne
Autorisation du fichier (icône cadenas)	Indique si l'utilisateur a l'autorisation de télécharger ce fichier. Le cadenas fermé indique que l'accès n'est pas autorisé, tandis que le cadenas ouvert indique que l'accès est autorisé. Voir aussi : Faire une demande d'accès.
Accès aux données (icône bouclier)	Indique le niveau d'accès requis pour télécharger le fichier. `C` représente une donnée contrôlée pour laquelle une demande d'accès est nécessaire. `R` représente une donnée pour laquelle l'usager doit simplement être un utilisateur enregistré sur le portail.
ID fichier	L'identifiant unique attribué à chaque fichier dans le portail du CQDG.
Jeux de données	Le jeux de données auquel le fichier appartient, si il y en a.
Étude	Le code de l'étude de laquelle est issue ce fichier de données. Voir l'outil d'exploration des études pour plus d'informations sur les études.
Catégorie de données	Pour l'instant il s'agit uniquement de données génomiques.
Type de données	`Aligned Reads` `Germline CNV` `Germline Structural Variant` `SNV` `Supplement` : métadonnées issues des pipelines bioinformatiques
Stratégie	La stratégie employée pour générer le fichier. `WGS` (whole genome sequencing) ou `WXS` (whole exome sequencing).
Format	`CRAM` : format utilisé pour les `Aligned Reads` `VCF` : format utilisé pour les `Germline CNV` et les `Germline Structural Variant` `gVCF` : format utilisé pour les `SNV` `TGZ` : format utilisé pour les données supplémentaires (`Supplement`)
Taille	La taille du fichier.
Participants	Le nombre de participants correspondant à ce fichier. Cliquez sur le lien pour naviguer vers l'onglet "Participants" avec ces individus sélectionnés.
Biospécimens	Le nombre de biospécimens depuis lesquels ce fichier de données a été généré. Cliquez sur le lien pour naviguer vers l'onglet "Biospécimens" avec ces biospécimens sélectionnés.
Nom du fichier	Le nom complet du fichier.
Plateforme	La plateforme utilisée pour générer la donnée.

Fichiers individuels

En cliquant sur le lien de l'ID du fichier, vous serez redirigé vers une page qui résume les informations disponibles pour ce fichier. En plus des informations déjà présentées dans l'explorateur de données, on y trouve notamment les sections détaillées "Procédure expérimentale" et "Analyse".